專業(yè)不同
1、區(qū)域一流大學：區(qū)域一流大學大部分的專業(yè)是一流。
2、區(qū)域高水平大學：區(qū)域高水平大學少部分的專業(yè)是一流。
級別不同
1、區(qū)域一流大學：區(qū)域一流大學的級別較高，受到國家財政長期重點投入、重點支持、重點傾斜、重點建設。
2、區(qū)域高水平大學：區(qū)域高水平大學的級別較低，通過“雙一流”、“特色重點學科項目”、“省部共建大學”、“2011計劃”、“部省合建大學”等國家層面的工程建設提升為區(qū)域一流大學。